SERVICES PROPOSES :

Culturomique : explorez la diversité microbienne !

Le plateau technique HIMIC de la SFR QUASAV met à disposition de la communauté scientifique, instruments et expertises pour isoler et caractériser la diversité microbienne (Bactéries – Champignons filamenteux – Levures – Oomycètes).

Il fait appel à des technologies haut-débit de suivi de croissance des micro-organismes (microplaques, millifluidique) et propose les expertises en microbiologie suivantes :

• Profilage métabolique
• Activité antimicrobienne
• Assemblage de communautés microbiennes synthétiques (Syncoms)
• Tests de compétition
• Tests d'invasion de syncoms
• Isolement par dilution-extinction

Le plateau soutient des projets de recherche sur le microbiote associé aux plantes qui ont vocation in fine à améliorer la vigueur et la protection des plantes grâce au pilotage du microbiote.

Responsable scientifique :

Marion FISCHER-LE SAUX
email : marion.le-saux@inrae.fr
Tél. : 02 41 22 57 19

Référents :

• Muriel Marchi : mycologie, suivi de croissance microbienne au néphélomètre
• Brice Marolleau : bactériologie, suivi de croissance bactérienne à l'AzurEvo (MilliDrop), Robot pipeteur
• Géraldine Taghouti : bactériologie, profilage métabolique avec l'Omnilog (Biolog)
• Cécile Dutrieux : énumération des cellules bactériennes au QUANTOM-Tx
• Perrine Portier : conservation des ressources microbiennes, lien avec le CIRM

LOCALISATION :

Le plateau HIMIC est situé sur le campus du végétal : 42 rue Georges Morel, 49070 Beaucouzé, France.
Le laboratoire de microbiologie du PTM est localisé dans le lien entre les bât. B et bât. C.

MATERIELS DISPONIBLES :

• AzurEvo (MilliDrop) : suivi de croissance en gouttes de 1 µL (jusqu'à 2000 gouttes) (scattering, fluorescence verte et rouge)
• Omnilog (Biolog) : profilage métabolique avec les plaques Biolog
• Néphélomètre (BMG-LabTech) équipé d'un empileur de plaques (capacité 48 plaques) : suivi de croissance fongique
• Robot pipeteur EpMotion 5073 (Eppendorf) préparation des plaques, assemblage de syncoms...
• QUANTOM Tx (Logos Biosystems) : énumération des cellules bactériennes totales et vivantes
• Laboratoire agréé pour la manipulation des organismes réglementés OGM et quarantaine